Os sintomas associados à infecção por covid-19 são variados, como febre, tosse, letargia e sintomas gastrointestinais como: diarreia, alterações das enzimas hepáticas com aumento do fígado e esteatose. Alguns trabalhos mostram que a diarreia está associada ao desequilíbrio do microbioma intestinal, com um declínio nos microrganismos benéficos (Lactobacillus e Bifidobacterium).

Atualmente, é entendido que ocorre uma interação dinâmica entre o microbioma e o eixo intestino-pulmonar, isto é, a comunidade bacteriana intestinal balanceada é vital para a imunidade pulmonar.

Numerosos estudos sugerem que as alterações desta flora (conhecida como disbiose), influenciam a modulação da resposta imune do pulmão.

Embora não haja nenhuma maneira do microbioma intestinal proteger contra o vírus, existem evidências científicas que mostram uma relação próxima entre a microbiota e os sistema imunológico, por isso é importante se considerar isto no combate ao coronavírus.

É muito cedo no entanto para recomendar probióticos para prevenir a pneumonia ou reduzir a mortalidade nestes pacientes, mas deve-se considerar o fortalecimento do sistema imunológico associado ao intestino, com o aumento do consumo de fibras, prebióticos e probióticos.